Di Jawa Tengah, gereja Protestan tersebar di berbagai kabupaten dan kota. Kota Semarang menjadi daerah dengan jumlah gereja Protestan terbanyak pada 2025, yaitu sebanyak 354 gereja.
Posisi berikutnya ditempati Kabupaten Semarang dengan 328 gereja, disusul Kota Surakarta sebanyak 226 gereja dan Kota Magelang sebanyak 220 gereja.
Sementara itu, Boyolali, Klaten, Pati, hingga Sukoharjo juga masuk dalam daftar 10 daerah dengan jumlah gereja Protestan terbanyak di Jateng.